Bioinformatyka | Studia magisterskie

Opis studiów

Zasadniczym celem studiów II stopnia na kierunku Bioinformatyka jest kształcenie specjalistów o wysokich kwalifikacjach, dysponujących wiedzą i umiejętnościami umożliwiającymi analizę i interpretację danych biologicznych i biomedycznych oraz przygotowywanie nowych metod i technik bioinformatycznych dla takich sektorów, jak biotechnologia, biologia molekularna i diagnostyka medyczna.

Kierunek łączy w sposób twórczy narzędzia biologii i informatyki w celu projektowania i przeprowadzania wielkoskalowych eksperymentów badawczych oraz wszechstronnej analizy wyników uzyskanych z badań genomicznych, transkryptomicznych, proteomicznych i biomedycznych. Ponadto absolwenci potrafią zaprojektować i skonstruować własne narzędzia informatyczne służące do rozwiązywania konkretnych problemów biologii molekularnej.

Kształcenie

bioinformatyka sekwencji i analiza danych pochodzących z sekwencjonowania nowej generacji
bioinformatyka strukturalna i analiza struktur biologicznych
bioinformatyka systemowa, ewolucyjna i populacyjna
projektowanie i tworzenie oprogramowania bioinformatycznego

Specjalności w ramach kierunku

Na kierunku nie wyodrębniono specjalności, jednak szeroka paleta przedmiotów fakultatywnych umożliwia studentom skoncentrowanie się na wybranych aspektach bioinformatyki – np. analizie danych genomowych, algorytmice czy bioinformatyce strukturalnej.

Sylwetka absolwenta

Absolwenci otrzymają tytuł zawodowy magistra i będą mieli możliwość podejmowania pracy w:

krajowych i zagranicznych laboratoriach bioinformatycznych, diagnostycznych i badawczych, instytucjach naukowo-badawczych
w przedsiębiorstwach zajmujących się tworzeniem i rozwojem oprogramowania bioinformatycznego (np. na potrzeby diagnostyki medycznej)
w działach badawczo-rozwojowych firm farmaceutycznych zajmujących się m.in. poszukiwaniem nowych leków
jednostkach doradczych i projektujących procesy biotechnologiczne
instytucjach zajmujących się obsługą biologicznych i medycznych baz danych
jednostkach administracji publicznej

Program studiów

#	Nazwa przedmiotu	Prowadzący	Pkt. ECTS	Forma zaliczenia
1	Metody statystyczne w bioinformatyce	prof. dr hab. Idzi Siatkowski	6	Egz.
2	Genomika	prof. dr hab. Wojciech Karłowski	5	Egz.
3	Biologia strukturalna	prof. dr hab. Maciej Kozak prof. dr hab. Szymon Krzywda dr Michał Taube	5	Egz.
4	Analiza filogenetyczna	prof. dr hab. Jacek Dabert dr Eliza Głowacka	5	Zal.
5	Język angielski	-	2	Zal.
Przedmioty obieralne Punktów ECTS do uzyskania: 7
1	Wykłady eksperckie	Wydział Biologii	1	Zal.
2	Modelowanie zjawisk ekologicznych	prof. UAM dr hab. Jakub Kosicki	3	Zal.
3	Finansowe, prawne i etyczne aspekty funkcjonowania nauki	prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek	2	Zal.
4	Mikrobiologia	dr hab. Ryszard Koczura	3	Zal.
5	Molekularna diagnostyka środowiska	dr hab. Mirosława Dabert	1	Zal.
6	Projekt bioinformatyczny I	prof. UAM dr hab. Marek Żywicki	3	Zal.

#	Nazwa przedmiotu	Prowadzący	Pkt. ECTS	Forma zaliczenia
1	Algorytmy uczenia maszynowego	dr Rafał Jaworski	6	Zal.
2	Bioinformatyka strukturalna	dr Jan Brezovsky	3	Egz.
3	Scientific Communication	prof. UAM dr hab. Mikołaj Olejniczak dr Savani Anbalagan	2	Zal.
4	Pracownia magisterska	-	10	Zal.
Przedmioty obieralne Punktów ECTS do uzyskania: 9
1	Wykłady eksperckie	Wydział Biologii	1	Zal.
2	Genomika medyczna	prof. dr hab. Paweł Zawadzki dr Alicja Woźna	3	Zal.
3	Rejestracja, przetwarzanie i analiza obrazów mikroskopowych	dr Anna Kasprowicz-Maluśki dr Tomasz Skrzypczak	2	Zal.
4	Projekt bioinformatyczny II	prof. UAM dr hab. Michał Szcześniak	3	Zal.
5	Zastosowanie chmury obliczeniowej w bioinformatyce	Radosław Januszewski	2	Zal.
6	Biologia systemowa	prof. dr hab. Borys Wróbel	3	Zal.

#	Nazwa przedmiotu	Prowadzący	Pkt. ECTS	Forma zaliczenia
1	Transkryptomika	prof. UAM dr hab. Michał Szcześniak	5	Egz.
2	Seminarium magisterskie	-	3	Zal.
3	Pracownia magisterksa	-	10	Zal.
Przedmioty obieralne Punktów ECTS do uzyskania: 12
1	Wykłady eksperckie	Wydział Biologii	1	Zal.
2	Wirusologia	dr Jakub Barylski prof. UAM dr hab. Robert Nawrot	2	Zal.
3	Projekt bioinformatyczny III	dr Andrzej Zieleziński	2	Zal.
4	Biokrystalografia	prof. dr hab. Szymon Krzywda	2	Zal.
5	Uczenie maszynowe w przetwarzaniu danych molekularnych	Mariusz Ferenc	3	Zal.
6	Kreowanie innowacji i przedsiębiorczości	Seweryn Olek	3	Zal.
7	Psychologiczne mechanizmy zachowań człowieka	dr hab. Tomasz Hanć dr Sylwia Tramabacz-Oleszak	3	Zal.

#	Nazwa przedmiotu	Prowadzący	Pkt. ECTS	Forma zaliczenia
1	Proteomika i metabolomika	dr Anna Baund	3	Zal.
2	Seminarium magisterskie	-	7	Zal.
3	Pracownia magisterksa	-	14	Zal.
Przedmioty obieralne Punktów ECTS do uzyskania: 6
1	Wykłady eksperckie	Wydział Biologii	1	Zal.
2	Metagenomika	dr Jakub Barylski prof. UAM dr hab. Ryszard Koczura prof. dr hab. Joanna Mokracka	2	Zal.
3	Struktura biomolekuł w roztworze	dr Michał Taube	3	Zal.
4	Wprowadzenie do głębokich architektur sieci neuronowych	Mariusz Ferenc	3	Zal.
5	Medycyna ewolucyjna	dr Mateusz Konczal	3	Zal.